Meskipun menawarkan banyak manfaat, teknologi kendaraan tanpa kunci juga menghadapi beberapa tantangan, terutama terkait dengan masalah keamanan.
Meskipun sistem ini dilengkapi dengan enkripsi tingkat tinggi, pencuri yang cerdas mungkin masih dapat meretas sinyal untuk mengakses kendaraan.
Beberapa kasus pencurian kendaraan dengan sistem keyless entry telah dilaporkan, mendorong produsen untuk terus mengembangkan dan memperkuat teknologi keamanan mereka.